10.3969/j.issn.1000-7423.2008.02.006
新的具有高度多态性的日本血吸虫微卫星位点的鉴定
目的 从基因组序列中选择和设定新的、可用于研究日本血吸虫多态性的微卫星位点.方法 672个日本血吸虫标本取自安徽、汀西、湖南、湖北和四川等5省的7个流行区现场.根据日本血吸虫基凼组数据库中的初始数据设计引物,对标本的17个全新的日本血吸虫微卫星位点进行分析.用GenMapper 4.0软件(Applied Biosystems)进行初始数据处理,用GenClone 1.0软件计算种群内各标本的遗传距离;用GenAlEx6软件统计等位基因的变化;用GenClone 1.0软件计算种群内各标本的遗传距离;用UPGMA谱系图分析种群间遗传距离.结果 17个微卫星位点均呈现多态性.对江西都吕种群的这17个位点进行分析,标本之间的遗传距离大多为25~32,显示江西都昌种群内各个标本之间的遗传差异明显.对7个地区种群分析的结果显示种群间的差异较为明显.类平均法系统聚类分析(UPGMA)谱系图显示,江两都昌、安徽铜陵、湖北沙市和湖南常德的种群同为一簇,其遗传距离为0.0178~0.036 3;安徽贵池和湖南岳阳的为另外一簇,其遗传距离为0.0247;而四川西昌单独为一簇,与其他两簇的遗传距离为0.0192~0.0693.结论 选择的17个微卫星位点可作为研究日本血吸虫种群遗传学的有效标记,并揭示中国大陆该虫种存在着复杂的遗传变异.
日本血吸虫、微卫星、多态性、中国
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R383.24(医学寄生虫学)
热带医学研究中心项目5P50AI39461;国家重点国际合作项目2003CB716804;国家高技术研究发展计划863计划目标导向专项2007AA02Z153;国家重点基础研究发展规划973计划前期项目2006CB708510;美国国立卫生研究院项目5P50AI39461
2008-07-01(万方平台首次上网日期,不代表论文的发表时间)
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