细粒棘球绦虫表面抗原MKK1的生物信息学分析
目的 运用生物信息预测网站及相关工具分析细粒棘球绦虫表面抗原MKK1 的理化性质、抗原性等.方法 EgMKK1 氨基酸序列经NCBI 数据库中下载,采用ProtParam 分析蛋白的理化性质,SignalP-5 分析信号肽,Euk-mPLoc 2.0进行亚细胞定位,ProtScale、SOSUI及DNASTAR分析亲疏水性,SOMPA分析二级结构,NetPhos分析磷酸化位点,MotifScan分析修饰位点,Swissmodel分析三级结构,TMHMM分析跨膜区域,ABCpred和IEDB预测B细胞抗原表位,SYFPEITHI 预测T 细胞抗原表位.结果 EgMKK1 由338 氨基酸序列组成,分子式为C1688 H2687 N471 O497 S17,亲水指数为-0.167456,为亲水蛋白;无信号肽,含2个跨膜区,且定位于细胞质及细胞核中.二级结构中α螺旋占43.20％,β折叠占10.95％,β转角占4.14％,无规则卷曲占41.72％.EgMKK1 能与HLA-A * 02-01结合,且能被HLA-DRB * 0401(DR4Dw4)分子呈递.结论 生物信息学预测EgMKK1 为亲水性蛋白,含有丰富的T、B细胞抗原表位,可为该蛋白的生物学功能研究及细粒棘球蚴病的防治研究提供参考.
细粒棘球绦虫、EgMKK1、生物信息学、抗原性
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R383.33(医学寄生虫学)
国家自然科学基金;国家自然科学基金;国家自然科学基金;自治区天池英才引进计划项目;自治区科技厅天山青年计划;国家重点实验室基金
2023-05-30（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）
共5页
406-410
