鸟分枝杆菌MAV-4563蛋白的生物信息学分析
目的 应用生物信息学方法预测分析鸟结核分枝杆菌MAV-dalidaxue4563基因编码蛋白的结构功能和生物学特性.方法 采用 Protparam、ProtScaleon Expasy,TMHMM Server v 2.0,SignalP4.1,PSORT,NetPhos 3.1,BLAST,SOPMA,Phyre2,ABCpred,SYFPEITHI等生物信息学软件分析MAV4563蛋白的理化性质、亲疏水性、跨膜区、信号肽、亚细胞定位、磷酸化位点、保守域、二结构及三级结构同源建模、B细胞和T细胞表位等生物学特征.结果 MAV4563基因全长756 bp,编码251个氨基酸的蛋白.该蛋白分子质量为28 ku,等电点为9.23,分子式(formula)为C1264H2013N385O353S7,为不稳定的疏水性蛋白.该蛋白无跨膜区,无信号肽,预测亚细胞定位于细胞质中,有13个磷酸化位点;蛋白二级结构中无规则卷曲占41.83％;预测该蛋白含多个B细胞和T细胞表位,其中MHC-Ⅰ型和MHC-Ⅱ型表位集中在蛋白C端的后90个氨基酸区域.结论 预测MAV-4563蛋白含多个B细胞和T细胞表位,其中B细胞表位和MHC-Ⅰ型表位集中在C端的后90个氨基酸区域,该区域可激活NTM特异性CTL和Th免疫应答,可作为非结核病的靶向疫苗抗原,为进一步研究该蛋白的治疗性T细胞疫苗奠定了基础.
鸟结核分枝杆菌、MAV-4563蛋白、T细胞疫苗
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R373.911(医学微生物学（病原细菌学、病原微生物学）)
国家自然科学基金No.81760357
2022-11-10（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）
共5页
1015-1019
