贵州省部分地区结核分枝杆菌MLVA基因分型研究
目的 应用多位点可变串联重复序列分析技术(MLVA)对贵州省结核分枝杆菌进行基因分型分析,为贵州省结核病防控提供科学依据. 方法 选取贵州省150株临床分离株结核分枝杆菌,采用水煮法提取基因组DNA,PCR扩增15个VNTR位点,统计菌株各VNTR位点的重复数目,通过遗传差异值(h)及Hunter-Gaston指数对VNTR位点进行遗传多态性及分辨力评价,采用BioNumerics 5.0软件对各菌株进行聚类关系和最小间距图(minimum spanning tree,MST)分析. 结果 PCR检测结核菌株VNTR各位点呈明显多态性,以Mtub21和MIRU26多态性尤为显著,以h值分别为0.559和0.505;MIRU10和ETRB显示较低基因多态性,h值分别为0.052和0.090.聚类分析显示,150株菌株分为Ⅰ、Ⅱ、Ⅲ、Ⅳ4个基因群,其中Ⅰ群占 10.67％(16/150),Ⅱ群占30.67％ (46/150),Ⅲ群占40.00％(60/150),Ⅳ群占18.67％(28/150).4个基因群呈现明显地域分布,毕节市以Ⅰ、Ⅱ群为主要流行菌株,安顺市以Ⅲ群菌株为主要流行菌株,遵义市以Ⅳ群菌株为主要流行菌株.MST分析显示,150株菌株形成3个克隆复合体(clonal complexes,CCs)及若干个独立分支(singleton),遵义、安顺、毕节分离株分别分布于不同的克隆复合体CCs. 结论 贵州省结核分枝杆菌存在明显的基因多态性和地域分布特性,以Ⅲ群和Ⅱ群菌株为主要流行菌株,应加强对上述两群菌株的监控.
结核分枝杆菌、MLVA、基因分型、贵州
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R378.911(医学微生物学（病原细菌学、病原微生物学）)
贵州省卫生计生委科技项目;贵州省科技计划;贵州省科技计划;贵州省结核分枝杆菌识别技术;遗传与分子流行病学特征研究项目;贵州省重要传染病实验诊断技术;分子流行病学研究科技创新人才团队专项资金项目
2020-04-29（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）
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