幽门螺杆菌临床分离株热休克蛋白60基因序列分析
目的 分析幽门螺杆菌(Helicobacter pylori,Hp)临床分离株热休克蛋白60基因编码区序列特征. 方法 对分离自我国不同地区、患有不同胃肠疾病患者的63株Hp提取基因组DNA并设计hsp60特异性引物,采用聚合酶链反应(PCR)扩增hsp60基因,经1％琼脂糖凝胶电泳后切胶回收、纯化PCR产物并测序,用DNAstar 5.0软件中的Clustal W程序对hsp60基因序列及由该序列翻译的氨基酸序列进行比较分析. 结果 成功特异性扩增并纯化到hsp60全基因序列.经序列比对,发现不同胃肠疾病来源的hsp60基因核苷酸序列在877、1 399以及1 579位点处存在单核苷酸多态性(single nucleotide polymorphism,SNP).其中来源于非胃癌患者的Hp在以上三位点处分别有8株(8/48,16.67％)G→A置换,9株(9/48,18.75％)C →G置换,7株(7/48,14.58％)A→G置换;胃癌患者来源的Hp在以上三位点处分别有3株(3/18,16.67％)G→A置换,1株(1/18,5.55％)C→G置换,2株(2/18,11.11％)A→G置换.将核苷酸序列翻译为氨基酸序列后,在以上三位点所对应的氨基酸序列,即293、467以及527位点处分别发生了由缬氨酸(V)到异亮氨基酸(Ⅰ)、谷氨酰胺(Q)到谷氨酸(E)以及苏氨酸(T)到丙氨酸(A)的改变. 结论 我国Hp临床分离株热休克蛋白60基因序列存在单核苷酸多态性位点.
幽门螺杆菌、热休克蛋白60基因、序列分析、单核苷酸多态性
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R378.99(医学微生物学（病原细菌学、病原微生物学）)
2014-05-29（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）
230-235
