1株福氏志贺氏菌分离株的16S rRNA基因序列分析
目的 对青海省1株经传统方法初步鉴定为福氏志贺氏菌的分离株(GH24)从16S rRNA基因水平做进一步分类与鉴定.方法 采用PCR方法扩增菌株GH24的16S rRNA基因并测序,将所得序列在GenBank、MicroSEQ ID和RDP数据库中进行同源性分析;利用ClustalX 1.83和Mega 5.0软件分析GH24与志贺氏菌属代表菌株间的进化关系.结果 GH24的16S rRNA基因序列长度为1 453 bp,在GenBank中与志贺氏菌属细菌同源性最高,为99%;在MicroSEQ ID和RDP数据库中与福氏志贺菌的同源性最高,为99.91%和100%.与志贺氏菌属代表菌株的多序列比较,GH24与福氏志贺氏菌的同源性为99.7%~99.4%,与其他志贺氏菌的同源性为99.2%~96.7%.系统发生树显示,GH24与福氏志贺氏菌属于同一进化分支.结论 运用16S rRNA基因序列分析鉴定分离株GH24为福氏志贺菌.该方法快速,结果可靠.
福氏志贺氏菌、16S rRNA基因、序列分析、细菌鉴定
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R378.25(医学微生物学(病原细菌学、病原微生物学))
2013-09-17(万方平台首次上网日期,不代表论文的发表时间)
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605-607