10.16372/j.issn.1004-6364.2021.01.003
应用系统进化方法评估徐海鸡遗传资源
利用简化基因组SNPs数据分析徐海鸡及周边地方鸡种遗传多样性,为徐海鸡的保护和利用提供支持.收集徐海鸡等13个地方鸡种血液样品,提取基因组DNA,应用简化基因组测序技术进行SNP分型,获取群体遗传学参数,并以邻接法、最大似然法、贝叶斯法构建系统进化树.结果显示:徐海鸡基因组SNPs观测杂合度为0.18,期望杂合度为0.28,在受试地方鸡种中品种内遗传多样性属于中等程度.Mantel测试表明遗传距离与地理距离呈现正相关(P＜0.05).系统进化树显示多数地方鸡种间存在明显界限.研究表明:徐海鸡独立成枝,与其它地方鸡种存在遗传上差别;地方鸡种之间存在有限的基因流;与最大似然法、贝叶斯法相比,邻接法更适合利用简化基因组数据构建系统进化树.
地方鸡、遗传多样性、GBS测序、Mantel测试、系统进化树
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S831.2(家禽)
江苏省公益类科研院所自主科研经费;江苏省家禽遗传育种重点实验室资助项目;现代蛋鸡产业技术体系建设专项
2021-03-05（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）
共6页
18-23
