10.3969/j.issn.1000-6923.2012.02.017
崇明东滩夏冬季表层沉积物细菌多样性研究
以长江口崇明东滩高、中、低潮滩夏、冬两季表层沉积物中基因组DNA为模板,PCR扩增样品中细菌16S rRNA基因V3区片段,通过克隆、测序,构建相应基因文库.系统发育分析结果表明,崇明东滩高、中、低潮滩表层沉积物共包含12个主要门类的细菌:变形菌门(Proteobacteria)(α-、β-、γ-、δ-和ε-亚群)、拟杆菌门(Bacteroidetes)、放线菌门(Actinobacteria)、酸杆菌门(Acidobacteria)、绿弯菌门(Chloroflexi)、厚壁菌门(Firmicutes)、螺旋体门(Spirochaetes)、疣微菌门(Verrucomicrobia)、浮霉菌门(Planctomycetes)、绿菌门(Chlorobi)、网团菌门(Dictyoglomi)、硝化螺旋菌门(Nitrospirae),此外还存在大量未被认知的序列.中潮滩和低潮滩的优势菌为变形菌,高潮滩的优势菌为拟杆菌.DOTUR多样性分析结果表明,崇明中潮滩细菌多样性最高,低潮滩次之,高潮滩最低；夏季细菌多样性高于冬季.夏、冬两季细菌群落差异高潮滩最大,低潮滩次之,中潮滩最小.
沉积物、细菌、多样性、16S rRNA、PCR、克隆、长江口
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X172(环境生物学)
国家自然科学基金资助项目41130525,41071135,40701167,40971268;中央高校基本科研业务费专项基金;海洋公益性行业科研专项经费项目200905007;河口海岸学国家重点实验室科研业务经费项目2010RCDW07;博士点基金项目20090076110020
2012-05-15（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）
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