10.7501/j.issn.0253-2670.2022.12.023
单叶铁线莲叶绿体基因组的序列特征与系统发育分析
目的 以药用植物单叶铁线莲Clematis henryi叶片为材料,在高通量测序、组装和序列分析的基础上,明确叶绿体因组的序列特征和系统发育关系.方法 利用CTAB法提取叶片基因组DNA,通过NovaSeq 6000平台测序,再用NovoPlasty组装叶绿体基因组,借助PhyML生成系统发育树.结果 单叶铁线莲的叶绿体基因组全长159 707 bp,GC值为38.0％,大单拷贝区、小单拷贝区和反向重复序列的长度分别为79449、18 100、31 079 bp;单叶铁线莲的叶绿体基因组总共有基因137个,其中蛋白质编码基因、tRNA、rRNA的数量分别为91、36、8,另有2个假基因,分别为Ψycfl和ΨinfA.序列比对结果表明,单叶铁线莲与牯牛铁线莲叶绿体基因组的相似性最高,达99.6％;共检测到41个SSR,其中40个为单核苷酸重复,1个为三核苷酸重复.系统发育分析结果表明,单叶铁线莲与牯牛铁线莲和大叶铁线莲聚于一组,支持率达100％.结论 单叶铁线莲叶绿体基因组的组装、序列分析和系统发育分析,为该药用植物的遗传结构和遗传多样性研究奠定了基础.
单叶铁线莲、牯牛铁线莲、大叶铁线莲、叶绿体基因组、序列特征、系统发育分析
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R286.12(中药学)
台州市211人才工程经费资助2012
2022-07-29（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）
共8页
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