10.7501/j.issn.0253-2670.2019.04.023
降解组测序技术对人参miRNA靶基因的分析鉴定
目的 分析鉴定人参miRNA靶基因.方法 采用降解组测序技术对石柱参(Shizhu ginseng)、园参(Yuan ginseng)的miRNA及靶基因进行检测;利用公共数据库KEGG/NR/GO数据库对降解组基因进行功能注释;通过荧光实时定量PCR(qRT-PCR)技术验证石柱参、园参的miRNA及靶基因表达量.结果 共得到8个miRNA家族的13个靶基因;利用KEGG/NR/GO数据库分析发现该miRNA的靶基因类型主要是转录因子、应答因子及信号转导通路等.对5个差异表达miRNAs:aqc-miR-159、bdi-miR 162、cpa-miR319、pgi-miR4376、smo-miR396及其靶基因进行的qRT-PCR验证结果与降解组测序结果一致.结论 明确了部分人参miRNA的靶基因,为进一步研究人参miRNA的可能功能奠定基础.
人参、石柱参、园参、miRNA、靶基因、降解组测序
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R282.12(中药学)
国家自然科学基金青年基金项目81403195;广东省自然科学基金项目S2013010015418
2019-04-25(万方平台首次上网日期,不代表论文的发表时间)
共6页
945-950