10.3969/j.issn.1001-2400.2014.06.016
一种新的D NA模体发现聚类求精算法
模体发现问题是分析基因转录调控关系的一个重要方面.提出了一种新的基于熵的聚类求精算法———ECRmotif,用于DNA序列中的模体发现问题.ECRmotif使用灵活的概率模型从背景序列中鉴别模体.它首先使用一个基于熵的聚类过程将数据集划分为若干子集,并对各候选子集压缩其实例的搜索空间,求精得到模体.通过模拟数据和真实数据的实验,表明 ECRmotif 算法可以有效地提高运行速度和效率,并准确地找出模体.
模体发现、聚类、求精
TP301.6(计算技术、计算机技术)
陕西省自然科学基金青年人才资助项目2013JQ8037;中央高校基本科研业务费专项资金资助项目K5051303002
2014-12-26(万方平台首次上网日期,不代表论文的发表时间)
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