10.3969/j.issn.1005-7021.2021.05.009
人肠源植物乳杆菌PUM1785全基因组测序分析与功能挖掘
植物乳杆菌(Lactobacillus plantarum)PUM1785是从潜在多重耐药患者的新鲜粪便标本中分离得到的一株具有良好生物学活性的乳酸菌,为了进一步研究其生物学特性和功能,对其进行全基因组测序并解析基因组序列信息及功能.利用Illumina HiSeq平台对植物乳杆菌PUM1785进行全基因组测序,利用相关生物信息学软件对原始数据进行组装及其后续的功能注释、次级代谢产物合成基因簇、致病性及分子进化分析.植物乳杆菌PUM1785基因组全长3128032 bp,GC含量44.56%;基因组特征显示其具有高碳水化合物代谢能力以及强抑菌和耐受活性,毒力因子主要表现为黏附和抵抗宿主免疫防御系统作用,属无致病性的毒力减弱型菌株.植物乳杆菌PUM1785能够黏附于宿主细胞,产生抗性蛋白和毒力因子,保护自身不受机体免疫防御的清除和破坏,能够在肠道内稳定定殖,适合作为微生态制剂或功能性食品生产菌株.
植物乳杆菌;基因组学;功能注释;细菌素;次级代谢;分子进化分析
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Q933(微生物学)
2018年福建省高等学校新世纪优秀人才项目;福建省卫生健康科研人才培养项目;福建省教育厅中青年教师教育科研项目;国家级大学生创新创业训练计划项目
2021-12-17(万方平台首次上网日期,不代表论文的发表时间)
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