褐马鸡圈养种群的mtDNA控制区多态性
褐马鸡(Crossoptilon mantchuricum)是我国特有的濒危鸟类,国家一级保护动物.为了保护褐马鸡的种质资源,从分子水平上评价褐马鸡的遗传多样性,对山西省庞泉沟自然保护区、太原市动物园的褐马鸡种群20个个体,线粒体DNA D-loop区全序列进行了克隆和测定,使用Clustal X、DnaSP4.0、Mega3.1等生物信息学软件,对全部20条序列开展了比对分析,确定了多态位点与单倍型数目,计算了核苷酸多样性和单倍型多样性;比较了两个种群的遗传变异,初步探讨了褐马鸡种群的遗传多样性和遗传结构.结果表明:20条褐马鸡线粒体DNA D-loop区全序列长度在1236-1237bp之间,其中A、T、G和C 4种核苷酸的平均含量分别为31.0%、26.8%、27.5%和14.8%,A+T含量(57.8%)高于G+C含量(42.3%).排除1处核苷酸的插人或缺失后,共检测出26个突变位点,占分析序列总长度的2.1%,其中包括25处单一多态位点和1处简约信息位点.20个个体检测出13个单倍型,其中11个个体具有独特的单倍型,2个共享单倍型.褐马鸡两个种群的单倍型多样性(h)为0.911-0.933,核苷酸多样性(π)为0.002-0.003,单倍型间的遗传距离为0.003-0.002.根据单倍型构建了褐马鸡两个种群的NJ分子系统树.聚类表明,2个种群的个体并没有按相应的地理位置进行聚类.揭示褐马鸡具有较高的单倍型多样性和较低的核苷酸多样性,种群的遗传变异较低;两个种群单倍型间的遗传距离较近,遗传多样性参数接近,统计分析无显著差异,两个种群尚未表现出明显的遗传分化,且两个种群间有基因流存在.
褐马鸡、mtDNA控制区、遗传多样性、保护
30
S83;S86
国家自然科学基金资助项目30570284;山西省自然科学基金资助项目2006011077;山西省高校科技开发资助项目20091037
2015-10-21（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）
共7页
2958-2964
