嗜水气单胞菌拮抗芽孢杆菌抗菌素相关基因分析
分别对抗鲟源嗜水气单胞菌的解淀粉芽孢杆菌G1的抗菌素相关基冈进行PCR扩增与测序,并对其编码产物的氨基酸序列、跨膜螺旋信号、结构域与二级结构等进行预测与分析.结果表明:菌株G1仪含有伊枯草菌素合成必需基因,该基因与GenBank基因库中芽孢杆菌属其他细菌的伊枯草菌素A、杆菌抗霉素D、抗霉枯草菌素等伊枯草菌素家族基因自然聚类,与枯草芽孢杆菌MH25株和RB14株的伊枯草菌素A基因16S rRNA序列有98%的高度同源性,而且其编码产物的氨基酸序列与GenBank中芽孢杆菌属其他细菌的伊枯草菌素、伊枯草菌素A、脂肽类化合物Bacillorin、芽孢菌素D等抗菌物质的氨基酸序列有高度同源性,与枯草芽孢杆菌MH25的伊枯草菌素A合成酶B(GenBank登录号:ABY89499)的亲缘关系最近.此外,菌株G1伊枯草菌素合成必需基因的编码产物不具有明显的跨膜结构,但其结构域中存在AMP结合位点和PP结合位点,二级结构中存在a螺旋、伸展链、β转角和无规则卷曲.
解淀粉芽孢杆菌、抗菌素相关基因、伊枯草菌素合成必需基因、系统发育分析
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Q939.97(微生物学)
国家现代农业产业技术体系建设专项CARS-46-12;国家"863"计划项目2011AA10A216
2014-07-08(万方平台首次上网日期,不代表论文的发表时间)
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