10.3969/j.issn.1000-2561.2020.02.011
椰子ZF-HD基因家族的鉴定及生物信息学分析
ZF-HD蛋白是一类只存在于植物体内且含有锌指结构域的转录因子家族,其不仅能够调节植物的生长发育,且在植物响应逆境过程中也起着重要的作用.本研究通过比对已开发的椰子基因组数据,共鉴定出20个椰子ZF-HD蛋白.采用生物信息学的方法,对其基因结构、蛋白理化性质、蛋白质保守结构域、超二级结构、系统进化树及表达谱进行分析.结果 显示:椰子ZF-HD蛋白多为碱性蛋白,且主要定位于细胞核、叶绿体及线粒体中.椰子ZF-HD基因家族可分为6个亚族,每个亚家族都具有相似的结构域和超二级结构.motif搜索分析显示,CoMIF亚族只含有锌指结构域保守序列,其他亚族均含有锌指结构域序列与同源异形盒结构域序列.表达谱分析显示,CoZHD18、CoZHD20在测序的各组织中表达较少,其他家族成员在各组织中的表达量具有差异性.
ZF-HD基因家族、椰子、生物信息学
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S667.4;Q786(果树园艺)
中国热带农业科学院基本科研业务费专项资金“重要热作种质资源收集、保存、评价和创新利用团队-椰子基因型鉴定”No.1630152017007
2020-05-07（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）
共8页
284-291
