10.3969/j.issn.1000-2561.2019.10.09
基于转录组的剑麻ARF基因家族的鉴定及表达分析
生长素反应因子(Auxin Response Factors,ARFs)是植物特有的多基因转录因子家族,参与植物生长发育过程的调节.本研究基于转录组数据,通过生物信息学方法鉴定剑麻ARF基因家族成员,同时对其进行相关生物信息学分析.结果表明:在剑麻中共鉴定得到15个ARF基因,并依次命名为AhARF 1～15.其编码的蛋白质含有409～1011个氨基酸,分子量约为45.17～112.13 ku,等电点为5.17～9.34.亚细胞定位预测结果显示,13个AhARFs定位于细胞核,2个AhARFs定位于叶绿体.保守结构域分析结果表明,AhARFs基因家族有8个成员同时含有B3、ARF和Aux/IAA这3个相对保守的结构域,其他成员仅含有B3和ARF这2个结构域.进化树分析表明,剑麻AhARFs蛋白可分为5个亚家族.15个剑麻AhARFs基因在剑麻紫色卷叶病不同发病时期呈现不同的表达规律.本研究为进一步深入探索剑麻ARF基因家族的功能奠定了重要理论基础.
剑麻、ARF、基因家族、转录组
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S563.8(经济作物)
现代农业产业技术体系建设专项CARS-16;中国热带农业科学院南亚热带作物研究所基本科研业务费专项1630062019021;海南省自然科学基金青年基金项目"剑麻AsMYC2 下游抗病关键基因筛选及鉴定"319QN288
2019-11-26（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）
共7页
1972-1978
