10.3969/j.issn.1000-2561.2017.02.021
5种蔷薇科树种多酚氧化酶比较基因组学分析
蔷薇科植物中有多种具有重要价值的水果,如苹果、梨、桃、草莓和黑树莓等.这些水果普遍容易发生由多酚氧化酶(PPO)介导的酶促褐变而导致重大经济损失,从全基因组角度分析比较PPO基因家族,有助于加深对PPO基因家族和功能的认识.采用比较基因组学的方法,对这5种植物的PPO基因家族进行了基因鉴定、染色体定位、编码蛋白的亚细胞定位、内含子统计分析、基因系统进化、基因倍增与丢失等特征分析.从这5种植物中,共计鉴定出了42个PPO基因,其中6个基因被认定是假基因;绝大多数基因编码的蛋白定位于叶绿体,2个定位于线粒体,3个是分泌型蛋白;PPO基因在染色体上有串联重复和散布两种形式;9个基因具有内含子,聚类结果显示可以将它们分为6个类型,每个基因类型在进化过程中都发生过基因倍增和丢失;同型基因内含子的位置和大小具有相似性.这些结果揭示蔷薇科植物PPO基因内含子是伴随着基因倍增产生的,基因倍增也是推动PPO基因多样化的重要动力,PPO基因倍增和丢失差异导致PPO基因数量在不同物种之间产生差异.
蔷薇科、多酚氧化酶、基因倍增、基因进化
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S661;Q786(果树园艺)
河北省留学归国人员择优支持资金资助和国家梨产业技术体系建设资助项目CARS-29-20
2017-04-19(万方平台首次上网日期,不代表论文的发表时间)
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320-327