10.3969/j.issn.1000-2561.2012.12.016
甘蔗核苷二磷酸激酶(NDPK1)基因克隆及表达分析
采用RT-PCR技术克隆了甘蔗核苷二磷酸激酶基因全长cDNA,并用荧光定量PCR分析该基因的表达情况.结果表明:克隆得到的cDNA片段长度为686 bp,包括1个450bp的开放阅读框,编码149个氨基酸,GenBank登录号为JQ712580.甘蔗与高粱NDPK基因cDNA序列的同源性为96%,氨基酸序列同源性为98%;该基因推导的蛋白分子量大小为16.83 ku,等电点为6.58,疏水性分值在-2.089~2.033;蛋白二级结构中α-螺旋占44.3%,随机卷曲占24.83%,延伸链占20.13%,β-转角只占10.74%.实时荧光定量分析结果表明,随着甘蔗干旱胁迫时间的延长,NDPK1基因表达均呈先升高后降低的趋势,30h达最大;在处理后的18、30、40h,PEG与PEG+Si处理的NDPK1基因的表达量有显著差异.
甘蔗、核苷二磷酸激酶、克隆、生物信息学分析、表达
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S566.1(经济作物)
国家科技支撑计划项目2007BAD30B00;科技部国际合作项目2008DFA30600、2009DFA30820;广西自然科学基金团队项目2011GXNSFF018002;广西科技攻关项目桂科能0815011;广西农业科学院团队项目桂农科2011YT01;广西农业科学院基本科研业务专项项目201019
2013-02-28(万方平台首次上网日期,不代表论文的发表时间)
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