10.12160/j.issn.1672-5190.2023.04.002
非洲猪瘟病毒pI215L蛋白结构与功能的生物信息学分析
[目的]研究非洲猪瘟病毒(African swine fever virus,ASFV)pI215L蛋白的结构与功能.[方法]从ASFV数据库(The African Swine Fever Virus Database,ASFVdb)下载 29 个不同ASFV毒株的pI215L基因序列,利用生物信息学工具分析不同毒株pI215L基因的同源性及遗传进化关系,预测pI215L蛋白的理化性质、二级结构、线性表位及三维空间位置.[结果]不同ASFV毒株的pI215L基因核苷酸序列同源性较高;pI215L蛋白性质不稳定,亲水性较高,二级结构主要含有α-螺旋、延伸链、β-转角、无规卷曲 4 种形式,含有 1 个E2 泛素化结合酶结构域;共有 16 处肽段是潜在的线性表位;使用SWISS-MODEL对pI215L蛋白的三级结构完成同源建模,在PDB数据库中与 6NYO.1(ubiquitin-conjugating enzyme E2 R2 和ubiquitin)的同源性达 46.06%;再使用PyMOL软件对pI215L蛋白进行构象表位预测,准确定位预测的表位三维空间位置在模型中的分布.[结论]该研究结果为解析pI215L蛋白的结构和功能以及研制ASFV疫苗和抗ASFV药物提供了参考.
非洲猪瘟病毒、生物信息学、pI215L蛋白、结构与功能
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S858.282.651(动物医学（兽医学）)
南阳师范学院理工科校级STP项目;河南省科技攻关项目;河南省高等学校重点科研项目;南阳市科技攻关项目
2023-09-13（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）
共7页
10-16
