期刊专题

10.12160/j.issn.1672-5190.2021.02.001

生物信息学软件预测猪氨基肽酶N功能与结构

引用
[目的]研究猪δ冠状病毒(PDCoV)入侵宿主细胞的感染机制,对其特异性受体猪氨基肽酶N基因编码蛋白功能与结构进行分析.[方法]通过多种生物信息学软件对pAPN蛋白的理化特性、亲疏水性、信号肽、跨膜区、糖基化位点、抗原表位、功能结构域及结构特征等进行预测分析.[结果]pAPN基因总长为2892 bp,编码963个氨基酸;其中,第35~963位氨基酸为膜外蛋白区,不含信号肽但包含2个典型的功能结构域.pAPN蛋白共有23个糖基化修饰位点和42个抗原表位.pAPN蛋白胞外域空间结构为二聚体,每个单体均可分为Ⅰ~Ⅳ4个结构域.[结论]该研究为了解pAPN蛋白与多种猪肠道冠状病毒相互作用的机制提供了思路.

猪氨基肽酶N、肠道冠状病毒、生物信息学软件、功能、结构

42

S852.651;S818.9(动物医学(兽医学))

国家自然科学基金项目"猪δ冠状病毒受体筛选、鉴定以及S蛋白介导的细胞入侵机制研究"3177131339

2021-05-11(万方平台首次上网日期,不代表论文的发表时间)

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畜牧与饲料科学

1672-5190

15-1228/S

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2021,42(2)

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