10.16138/j.1673-6087.2023.02.006
LINC01465在痛风性关节炎中的表达及临床意义
目的:探索痛风性关节炎(gouty arthritis,GA)潜在发病相关长链非编码 RNA(long noncoding RNA,lncRNA)及与炎症因子的相关性.方法:通过基因表达综合(Gene Expression Omnibus,GEO)数据库获取GA芯片数据,通过多种机器学习方法筛选并取交集得到关键的lncRNA.分析与lncRNA共表达的mRNA,并进行GO富集分析及京都基因与基因组百科全书(Kyoto Encyclopedia of Genes and Genomes,KEGG)信号通路分析.通过实时荧光定量PCR(quantitative real-time polymerase chain reaction,qRT-PCR)验证关键lncRNA在GA患者中表达情况与炎症因子水平相关性,并绘制受试者操作特征曲线(receiver operator characteristic curve,ROC曲线)分析LINC01465 表达水平对GA患者诊断价值.结果:筛选出GA关键lncRNA 1 个(LINC01465).GO富集分析结果显示富集于RNA剪接、氧化磷酸化、还原型烟酰胺腺嘌呤二核苷酸(reduced nicotinamide adenine dinucleotide,NADH)脱氢酶活性等功能.KEGG信号通路分析显示主要富集于烟酸和烟酰胺代谢、磷脂酰肌醇 3 激酶(phosphoinositide 3-kinase,PI3K)-Akt、肿瘤坏死因子信号等代谢及炎症通路.qRT-PCR结果显示在GA患者中LINC01465 表达上调,与红细胞沉降率(r= 0.658,P=0.030)、C反应蛋白(r=0.660,P=0.040)、白介素-6(r=0.794,P=0.008)表达呈正相关.ROC曲线下面积为 0.86.结论:LINC01465 可能是GA潜在的诊断及治疗靶点.
痛风性关节炎、LINC01465、机器学习、信号通路
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R593.22(全身性疾病)
广东省中医药局中医药科研项目;深圳市福田区卫生公益性科研项目;深圳市福田区卫生公益性科研项目;深圳市福田区卫生公益性科研项目
2023-06-05（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）
共7页
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