不同猪种IGF1R基因扩增及SNPs的筛选
以小型猪(巴马香猪46头)和大型猪(长白猪、大白猪、杜洛克猪,共198头)为试验对象,采用PCR产物直接测序法对胰岛素样生长因子1受体(IGF1R)外显子进行SNPs筛查,根据测序结果确定每个SNP位点的基因型,并通过Haploview软件对筛选到的SNPs进行连锁不平衡及单倍型分析.结果表明:在不同体型猪IGF1R基因外显子121上共筛选到9处同义SNPs位点,为G263C(rs338724264)、T17G(rs325909655)、C145T(rs337838116)、T40C(rs326728191)、C104T(rs319719983)、C170T(rs338444971)、C60T(rs327750836)、C126T(rs327750836)和C82T(rs339449791).这9个SNPs在巴马香猪和大型猪中均为纯合子突变,且呈现完全连锁不平衡.此研究明确了不同体型猪IGF1R基因外显子区SNPs的基因型及由这些SNPs形成的优势单倍型,可为探究不同猪种生长发育过程中体尺存在差异的原因提供新数据.
猪、IGF1R基因、SNPs、基因型、连锁不平衡
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S828(家畜)
白城师范学院博士科研启动基金;国家自然科学基金项目31672514, 31772699;吉林省科技发展计划项目20170101024JC;吉林省教育厅项目JJKH20190017KJ
2019-05-31(万方平台首次上网日期,不代表论文的发表时间)
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