版纳微型猪近交系BARD1基因克隆、mRNA表达及蛋白质功能生物信息学分析
BARD1基因在精子形成过程中起重要作用.以GenBank下载的牛、鼠BARD1基因序列以及猪EST序列克隆猪BARD1基因,设计特异引物克隆版纳微型猪近交系(BMI) BARD1基因.应用qPCR分析15个重要组织的mRNA表达谱,并对蛋白质序列进行功能生物信息学分析,构建多物种系统进化树.研究获得了BMI BARD1 2 334 bp的编码区序列(GenBank登录号KU705640,对应的氨基酸登录号AOC89058),编码777个氨基酸,蛋白质分子量(Mw)为86.15 ku,等电点(pI)为8.84.多组织荧光定量表达分析表明:BARD1基因在睾丸和尿道球腺中高表达,在肝脏、脾脏、肺、十二指肠、结肠中中度表达,在心脏、肾脏、胃脏、脑、肌肉、精囊腺、前列腺、附睾中低表达.功能生物信息学分析表明,BARD1蛋白质存在3个保守结构域,无跨膜结构,无信号肽序列;N末端疏水,C末端亲水;有6类功能活性位点,位于细胞核的概率是94.1％.系统进化分析表明,BMI与牛、羊的亲缘关系最近.
BRCA1相关联的指环蛋白1、版纳微型猪近交系、生物信息学、组织表达
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O78;S828.2(晶体生长)
国家自然科学基金项目31460580,31660637,31660650
2018-04-08（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）
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