10.11855/j.issn.0577-7402.2016.05.03
宫颈癌中转移相关基因MTA1高表达的临床意义及其协同表达基因的生物信息学分析
目的 分析转移相关基因MTA1高表达与宫颈癌临床转移的相关性,并筛选MTA1协同表达基因网络中的潜在干预靶点基因.方法 应用SPSS软件分析TCGA-CESC数据集中MTA1与宫颈癌转移和病理分级的相关性,应用edgeR软件分析该数据集中MTA1高表达组与低表达组的全转录组差异表达基因,应用DAVID平台对这些差异表达基因进行聚类分析,应用STRING在线平台和Cytospace软件对这些基因进行互作网络分析,筛选关键的网络节点基因.结果 TCGA-CESC宫颈癌数据库中MTA1表达水平与肿瘤临床转移和病理分级呈显著正相关(P＜o.o1),在不同MTA1表达水平的宫颈癌转录组中存在显著且较一致的差异表达基因集,这些基因主要聚集在癌症通路、干细胞通路、细胞转移、细胞分化等方面,与肿瘤的恶性生物学行为显著相关.基因筛选显示,宫颈癌中与MTA1协同表达的Agt、Acta1、Fpr2、Pmch和RGS18等基因是差异表达基因集中最重要的节点基因,这些基因聚集在GPCR相关通路.结论 MTA1高表达与宫颈癌转移显著相关,且与肿瘤细胞的干细胞通路、趋化因子受体通路、细胞转移、细胞分化等基因调控网络活化相关.MTA1的协同表达基因网络中的节点基因可能参与了宫颈癌的转移调控,并最有可能成为宫颈癌治疗的分子靶点.
转移相关基因1、宫颈肿瘤、计算机生物学
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R737.33(肿瘤学)
国家自然科学基金81572842,81372159;北京市自然科学基金7132071;北京市卫生系统高层次卫生技术人才学科骨干项目2015-3-090This work was supported by the National Natural Science Foundation of China 81572842,81372159,the Natural Science Foundation of Beijing 7132071,and the Discipline Key Project of High Level Health Technical Personnel in Beijing Health System 2015-3-090
2016-07-25（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）
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