Sirt1及Sirt2与活性分子INA的作用机制研究
应用分子模拟理论与方法研究了人类沉默信息调节因子2相关酶类Sirtuin家族成员Sirt1及Sirt2与一种活性分子(命名为INA)的作用机制.同源模建了Sirt1的三维结构,通过分子对接手段得到Sirt1 (NAD+)-INA及Sirt2(NAD+)-INA的两种复合物体系,进行了分子动力学模拟.并且分别计算了两种体系中关键氨基酸残基与INA的结合自由能值,由此推测出Sirt1(NAD-)-INA、Sirt2(NAD+)-INA体系结合位点分别为Va172,Ser73和Arg272及Phe235,Leu264和Gly305,确证了两种体系的结合模式.模拟结果表明,在Sirt1 (NAD+)-INA体系中,INA与催化底物NAD+距离较近,可以相互作用,具有较高活性;在Sirt2(NAD+)-INA体系中,INA与催化底物NAD+距离较远,与在Sirt1体系中比较,INA对Sirt2体系的活性较弱,结果与实验--致.本文的研究,对今后以去乙酰化酶Sirt1,Sirt2为靶点的新药开发具有一定指导意义.
分子模拟、Sirt1、Sirt2、活性分子INA、作用机制
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项目受吉林省自然科学基金20101552;教育部博士点专项基金20090061120101;吉林大学基本科研业务费专项资金450060488101
2013-04-16(万方平台首次上网日期,不代表论文的发表时间)
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