10.14001/j.issn.1002-4093.2020.04.001
InDel在种间进化关系研究中的解析力初探
系统发育分析是揭示物种间进化关系的重要方法.由于插入/缺失(Insertion/Deletion,InDels)变异情况的复杂性,大多数研究进行系统发育分析时往往只考虑单核苷酸碱基替换(Single nucleo-tide polymorphism,SNPs),忽略了InDels的遗传变异信息.为揭示InDels在系统发育分析中的解析力,本研究对花生属13个物种叶绿体基因组全序列的遗传变异信息(SNPs和InDels)进行统计和处理,首先依据全部SNPs变异所构建系统树的拓扑结构,确定的NJ树分支系统关系揭示所需SNPs饱和变异数目.结果显示,当SNP数目达到3000个之后,拓扑结构持续保持稳定.研究发现InDels能够增加系统发育树中某些节点的分辨率,但其解析力低于同等数目的SNP的解析力.综上,InDels作为主要遗传变异形式之一,能够为准确解析系统进化关系提供有力支持.
系统发育分析、遗传变异、InDels信息、种间讲化
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Q754;Q349+.5(分子遗传学)
泰山学者特聘专家项目;青岛市科技惠民计划项目;山东省农业科学院农业科技创新工程项目
2021-02-25（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）
共7页
1-6,13
