10.3964/j.issn.1000-0593(2020)03-0873-05
桉树杂交种与其亲本的近红外光谱判别
研究桉树控制授粉后目标性状的基因作用方式是探索其基因重组规律的重要内容.常规的数量统计分析精度往往不高,而DNA分析的专业要求高,且费时费力.该研究利用近红外光谱(NIRs)研究不同基因型桉树杂交种、亲本及杂交种与亲本间近红外光谱信息的关系,探索NIRs用于桉树杂交种与其亲本判别的可行性和准确性.以控制授粉的桉树亲本及其杂交F1代材料为对象,每种基因型从各自田间试验分别选取10个单株,采集树冠中上部新鲜健康叶片.用手持式近红外仪Phazir Rx(1624)采集桉树杂交种与其亲本叶片的NIRs信息.每单株选10片完全生理成熟的健康叶片,避开叶脉扫描其正面光谱5次,以50条NIRs信息的均值代表单个叶片的NIRs信息,最终每个基因型获得10条NIRs信息.对原始NIRs采用二阶多项式S.G一阶导数预处理.预处理后的N IRs用于多元统计分析,首先对桉树杂交亲本和子代样本进行主成分分析(PCA),直观展示不同基因型的分类情况.然后运用簇类独立软模式(SIMCA)和偏最小二乘判别分析(PLS-DA)两种有监督的判别模式验证NIRs用于桉树杂交种与其亲本树种的分类判别效果.PCA结果显示,不同的亲本间、杂交种间及杂交种与亲本间样本的主因子得分可以清晰地将各基因型分开.SIMCA模式判别分析中,桉树杂交种样本到亲本PC A模型的样本距离显示,待判别样本能够形成单独的聚类,且能直观反映两者的遗传相似.PLS-DA判别结果显示,桉树杂交亲本的PLS模型能通过预测其杂交子代的响应变量将其与亲本准确分开.结果表明,桉树叶片的N IRs信息可以准确地反映桉树杂交子代遗传信息的传递规律,NIRs判别模型可以准确地将各种基因型予以区分.因此,NIRs信息不仅可用于桉树杂交种和纯种的定性判别,还可以分析桉树基因重组过程中加性遗传效应的大小,从而为桉树遗传基础分析及其育种改良研究提供理论支撑.
有监督的模型、主成分分析(PCA)、簇类独立软模式(SIMCA)、偏最小二乘判别分析(PLS-DA)
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S722.34(造林学、林木育种及造林技术)
国家自然科学基金青年项目31700599;国家自然科学基金面上项目31670680
2020-04-10（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）
共5页
873-877
