铅镉胁迫下刺槐转录组序列的SSR和SNP特征分析
为了解铅镉胁迫下刺槐(Robinia pseudoacacia)转录组中SSR、SNP的具体情况,对刺槐幼苗铅镉胁迫0、3、45 d后Illumina Hiseq测序,从得到的Unigene中筛选并识别出SSR和SNP位点.结果显示,刺槐转录组中,SSR发生频率、出现频率分别为30.65％、14.20％;单(6 547)、双(2 538)、三碱基重复(2 011)SSR数目最多且逐次递减;基序中AG/CT(6.68％)、GAA/TTC(1.88％)占比较大;6～10次的重复占比超六成;10～20 bp长的重复序列占比超90％;SNP变换类型中转换(93 955)远高于颠换(63 616).从刺槐83 470条Unigene中挖掘出的11 853个SSR位点和157 571个SNP位点,促进了刺槐耐受铅镉胁迫功能基因的研究及其分子育种等工作的开展.
刺槐(Robinia pseudoacacia)、转录组、铅镉胁迫、SSR、SNP
20
Q938;S663.4;P467
河南省科技攻关项目202102110053
2022-12-15（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）
共7页
6824-6830
