基于表型数据的菊芋核心种质初步构建
为更好地保存、研究和利用现有菊芋种质资源,本研究以250份种质材料的19个表型性状数据为基础,采用逐步系统聚类并优化聚类和取样方法,初步构建遗传冗余少、代表性强的菊芋核心种质.结果表明,在25％取样比例下多种系统聚类方法抽取的核心种质中,以最短距离法(C4)和优先取样法(S3)组合的C4S3方法所抽取的核心种质评价参数优于其他方法,对原种质的代表性最强.在C4S3法下优化取样比例,结果显示最合适的取样比例为20％,所抽取的核心种质C4S3-20用较少的材料获得了较高的遗传代表性.在C4S3-20方法下继续进行分组取样,评价参数表明分组取样效果不如整体取样,因而不予采纳.主成分分析显示C4S3-20保留了原种质的主成分,去掉了原种质的遗传冗余.最终获得了菊芋核心种质C4S3-20,包括50份材料,其与原种质的性状均值差异百分率为0％,方差差异百分率63.63％,极差符合率为100％,变异系数变化率为131.38％,表型保留比例为96.15％;Shannon多样性指数为1.595.本研究发现该核心种质很好地代表了原种质的遗传多样性,在一定程度上为菊芋资源的有效利用奠定了基础.
菊芋(Helianthus tuberosus)、核心种质、表型数据、系统聚类、遗传多样性
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本研究由国家自然科学基金;2017中科院西部之光人才培养项目;青海省科技厅重点实验室项目;青海省科技基础条件平台
2021-07-01（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）
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