尼泊尔黄堇G6PDH基因的克隆和生物信息学分析
为了深入发掘该基因在尼泊尔黄堇生态适应和次生代谢物积累中的作用机制,本研究依据转录组中葡萄糖-6-磷酸脱氢酶(G6PDH)基因的注释信息,应用聚合酶链式反应(PCR)技术克隆了尼泊尔黄堇G6PDH基因,通过生物信息学方法进行相关分析.结果表明:克隆的G6PDH基因的开放阅读框(ORF)为1 581 bp,编码526个氨基酸.系统进化树分析表明尼泊尔黄堇G6PDH蛋白氨基酸序列与博落回、罂粟等具有很高的相似度,尤其与同是罂粟科的博落回相似度最高,相似度达到91％.通过一系列生物信息学分析发现,ChG6PDH蛋白分子量为59.83 kD;理论等电点为6.37;该蛋白为不稳定、亲水性、非分泌性蛋白,无跨膜结构域;二级结构中具体α-螺旋(40.11％)和β-折叠(6.08％)、无规则卷曲(40.87％)以及延伸链(12.93％)结构,预测得到的三级结构中具有典型的NADPH结合位点.该基因的成功克隆和预测结果将为进一步研究ChG6PDH基因在尼泊尔黄堇生长发育、逆境适应和次生代谢物积累等方面中的功能提供帮助.
尼泊尔黄堇(Corydalis hendersonii Hemsl.)、生物信息学分析、葡萄糖6磷酸脱氢酶、基因克隆、次生代谢物
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本研究由国家自然科学基金青年项目;国家自然科学基金地区项目;青海科技厅基础研究项目;教育部春晖计划项目;青海省重点研发与转化计划项目;青海大学创新创业工坊建设项目;海南藏族自治州科技计划项目"海南州野生甘蒙锦鸡儿驯化研究"共同资助
2021-07-01（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）
共7页
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