枣裂果相关的基因筛选
为了解枣果实开裂与基因表达的关系,并筛选出与裂果相关的基因,本研究以易裂品种'伏脆蜜'为材料,利用Illumina测序平台对裂果和非裂果部位果皮进行转录组测序分析,结果表明裂果部位和非裂果部位两个样品中分别获得10025和10041个表达基因,其中9802个基因在两个样品中都有表达,有223个基因在裂果部位中特异表达,有239个基因在非裂果部位中特异表达;在裂果果皮部位对比非裂果果皮部位中筛选出差异表达基因161个,其中上调表达基因39个,下调表达基因122个.通过对基因功能和KEGG代谢通路上基因差异表达筛选,主要在合成木质素的通路上发现2个基因(gene16874和gene 17086);在植物激素信号转导中,发现 1个 AUX/IAA(gene26281)、1 个 ARF(gene22744)和 1 个 SAUR(gene7576)及1个 JAZ(gene2607)基因;在植物病原体相互作用代谢通路中,2个CML(gene 19427和gene19466)基因;在淀粉和蔗糖代谢通路中,有1个β-淀粉酶(gene32293)基因和1个Endoglucanase 12(gene3673)基因.结合转录组数据分析和利用RT-qPCR验证,上述10个差异表达基因在裂果果皮中都高表达,说明这10个基因可能参与裂果的发生过程.
裂果、果皮、转录组、RT-qPCR
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本研究由国家自然科学基金项目;兵团中青年科技创新领军人才计划项目;南疆重点产业科技支撑计划项目
2021-07-01(万方平台首次上网日期,不代表论文的发表时间)
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3196-3207