马铃薯空心块茎转录组分析
空心是马铃薯块茎内部生理缺陷性状,它会严重影响马铃薯的鲜食和加工.为了解马铃薯空心块茎不同形成时期的差异表达基因和探究与空心块茎形成密切相关功能基因.本研究采用RNA-Seq技术对马铃薯空心敏感性材料('5-19')块茎无空心期(N)、空心轻微期(S,空心长度0～1 cm)、空心较重期(M,空心长度1～3 cm)进行转录组分析.结果显示,各送样样品高质量碱基均达到6.54 Gb,各组样品Q30碱基百分比均在94.15％以上.N-vs-S 和 S-vs-M 的差异表达基因(differentially expressed genes,DEGs)数目分别为44和 130个.GO功能注释显示差异表达基因主要集中在代谢过程、细胞过程、单组织过程、结合、催化活性、细胞组分等.KEGG代谢通路富集发现,差异表达基因显著富集到角质素、木栓质、蜡状物合成、苯丙烷生物合成、脂肪酸延长、苯丙氨酸代谢等途径.进一步分析挖掘到19个与马铃薯块茎空心形成相关基因.本研究解析了马铃薯空心块茎形成过程中的转录调控分子机制,为后续研究提供了相关基因数据信息.
马铃薯、空心、转录组、差异表达基因
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本研究由国家自然科学基金;云南省应用基础研究计划面上项目
2021-07-01（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）
共11页
3185-3195
