期刊专题

10.13271/j.mpb.019.003150

玉米ZmZFP36基因的克隆与生物信息学分析

引用
玉米(Zea mays)是世界上最重要的粮食作物之一,研究其抗逆性机理有着十分重要的意义.本研究用在线软件预测了玉米miR408的靶基因,对其中编码锌指蛋白的靶基因ZmZFP36进行了生物信息学分析,并构建了该基因的植物表达载体.研究结果表明,ZmZFP36的转录本全长为1169 bp,无内含子,开放阅读框长度为702 bp,编码的蛋白质分子量为24.52 kD;具有亲水性,无跨膜结构域;二级结构包含无规则卷曲、α-螺旋、延伸链和p-转角,所占比例分别为69.10%、20.60%、7.73%和2.58%;系统进化树分析表明ZmZFP36蛋白与小米(Setaria italica)、高粱(Sorghum bicolor)蛋白亲缘关系最近.启动子分析结果表明,它含有低温、干旱及脱落酸等多种非生物胁迫响应元件,有助于后期通过遗传转化的方法进一步研究miR408的调控机理.

玉米、microRNA、靶基因、ZmZFP36、生物信息学分析

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本研究由湖南省自然科学基金;国家重点实验室培育基地开放课题

2021-07-01(万方平台首次上网日期,不代表论文的发表时间)

共7页

3150-3156

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1672-416X

46-1068/S

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2021,19(10)

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