紫苏SNP分子标记开发及遗传多样性分析
紫苏(Perillofrutescens(L.))是一种药食兼用型的植物,具有丰富的营养价值和药用价值,本研究利用特异性位点扩增片段测序技术(specific-locus amplified fragment sequencing,SLAF-seq)对30份紫苏种质资源进行了分子标记开发,以”日本晴”(水稻)为对照,测序获得紫苏全基因组范围内的SNP分子标记.通过测序共获得106.92 Mb Reads数据,各样本Reads数据在1 742 153～9 815 872之间,样本平均测序质量值Q30为95.91％;平均GC含量为39.16％.通过生物信息学分析,本研究获得406 599个SLAF标签,样本的平均测序深度为19.13倍,其中多态性的SLAF标签共有140 387个,共得到419 223个群体SNP标记.利用开发的SNP分子标记将30份紫苏种质资源分为2组,紫苏SNP分子标记的研究可为紫苏的遗传图谱构建、种质资源鉴定以及农艺性状的关联分析提供理论基础.
紫苏(Perilla frutescens(L.))、SNP、SLAF-seq技术、分子标记
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本研究由现代农业产业技术体系建设专项;河北省中药材产业技术体系育种岗位项目
2021-04-01（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）
共7页
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