乳油木叶绿体基因组密码子偏好性分析
为了解乳油木叶绿体基因组密码子的使用模式,该研究以从乳油木叶绿体基因组中筛选得到53条长度大于300 bp且非重复的CDS (Coding DNA sequence)序列为材料,利用Codon W 1.4.2和在线软件CUSP分析其密码子偏好性.结果 显示,密码子第3位GC含量为27.47%,ENC范围在36.31~56.88,平均值为42.98.RSCU值大于1的密码子有28个,其中27个以A或U为结尾.中性绘图分析、ENC-plot分析和PR2-plot分析的结果显示乳油木叶绿体基因密码子偏好性主要受突变的影响.最优密码子为GGA、GAU、CAU和UUG.本研究结果为提高异源基因表达水平、改良乳油木重要经济性状等提供参考依据.
乳油木(Vitellaria paradoxa)、叶绿体基因组、密码子偏好性、突变
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S567.23+9;Q786;O969.36+7.3
国家自然科学基金;云南省林业科学院热带亚热带珍贵用材树种研发省创新团队共同资助
2020-09-30(万方平台首次上网日期,不代表论文的发表时间)
共7页
5658-5664