基于RNA-Seq技术的茶树响应高温胁迫转录组差异性分析
为探索茶树响应高温胁迫的分子生理学机制,本研究通过转录组和数字基因表达谱技术,对高温胁迫前后的”福鼎大白茶”、”早白尖5号”两组茶树的差异表达进行分析,并基于转录组数据筛选鉴定茶树中与适应高温胁迫相关的保护基因和调控基因.结果 显示,项目共测序获得53.7 Gb数据,组装并去冗余后获得的各样本Unigene均超过60 976条,总长度,平均长度,N50以及GC含量分别大于53 974 945 nt,840 nt,1 411 bp和41.36％.使用Blast将Unigene比对到七大功能数据库进行注释,在核苷酸序列信息库(nucleotide collection,NT)中被注释的Unigene序列最多,有109 581 (63.53％)条;高温胁迫后,”福鼎大白茶”高温胁迫(fuHT) vs”福鼎大白茶”常温对照(fuCK)和”早白尖5号”高温胁迫(zaoHT) vs”早白尖5号”常温对照(zaoCK)两个比较组分别筛选获得5 256和5 765个差异性表达基因,其中”福鼎大白茶”上调基因4 379个,下调877个,”早白尖5号”上调基因4 997个,下调768个.将差异基因按GO功能分类,”福鼎大白茶”、”早白尖5号”高温胁迫后差异基因均富集到41个类别中,分属于GO功能分类体系的生物学过程、细胞组分和分子功能.将差异基因进行KEGG功能分析,”福鼎大白茶”、”早白尖5号”两个对比组显著富集的代谢通路(pathway)前3名均为代谢途径、内质网中的蛋白质处理、次级代谢物的生物合成.选取17个在高温胁迫后被诱导的基因,利用实时荧光定量PCR (qRT-PCR)对高通量测序数据进行验证,证明测序结果真实可靠.本研究筛选出大量与高温胁迫相关的响应基因,为下一步耐热茶树新品种的选育提供了更多的理论参考.
茶树(Camellia sinensis)、高温胁迫、转录组测序、差异表达基因、qRT-PCR
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本研究由重庆市基础科学与前沿技术研究专项项目;重庆市农业发展资金项目;重庆科技攻关计划项目;重庆市农业发展资金项目
2020-09-30（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）
共9页
5629-5637
