葫芦科PAL基因家族生物信息学分析及甜瓜PAL4基因克隆
苯丙氨酸解氨酶是苯丙烷代谢途径的第一个酶,对植物发育、抗逆及信号传导起着尤为重要的作用.为了在葫芦科作物中更为深入地研究苯丙氨酸解氨酶的结构及理化性质、发掘更多潜在的苯丙氨酸解氨酶基因,本研究从拟南芥(Arabidopsis thaliana)4个苯丙氨酸解氨酶基因(At-PAL)入手,通过BLAST比对方法在葫芦科数据库(http://cucurbitgenomics.org/)中鉴定甜瓜(Cucumis melo L.)、西瓜(Citrullus lanatus)、黄瓜(Cucumis sativus L.)苯丙氨酸解氨酶的同源基因,并进行其生物信息学预测分析.结果表明:在甜瓜、西瓜、黄瓜中分别比对出4条、6条、5条同源基因,分别命名为MELO-PAL 1～4、Cla-PAL 1～6、Csa-PAL 1～5.其各级结构及理化性质与拟南芥苯丙氨酸解氨酶基因均较为相似.并对它们进行了系统进化树的构建,结果表明各物种间苯丙氨酸解氨酶基因家族间同源性较高,并利用分子生物学的手段,克隆了甜瓜的第四条比对基因(MELO-PAL4),将其连入T载体中进行测序.测序结果显示,克隆的基因序列与比对序列间总体相似度为92.54％.本研究为进一步发掘葫芦科作物PAL基因功能提供了重要的帮助.
苯丙氨酸解氨酶、葫芦科、二代测序、生物信息学分析、基因克隆
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Q943.2;Q785;S852.65
国家自然科学基金;国家西甜瓜产业技术体系项目
2018-10-31（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）
共11页
4910-4920
