枣GATA转录因子家族生物信息学分析
为了深入研究枣GATA转录因子家族的基因功能以及为枣的分子育种提供科学依据.本研究利用NCBI、TAIR、Planttfdb、HMMER、Pfam、SMART、MEME、GSDS、Plant Care、STRING在线网站以及DNAMAN6、Map Inspect和MEGA5软件,对枣GATA转录因子的个数、理化特征、染色体定位、系统进化树、保守基序、基因结构和蛋白功能联系预测进行了分析.结果表明:枣含有28个GATA转录因子,根据结构域的不同分为四个亚族:GroupⅠ、GroupⅡ、GroupⅢ和GroupⅣ.其中GroupⅢ和GroupⅣ处在进化树的同一分支.另外,枣12条假染色体上共鉴定到7条染色体分布有枣GATA基因(22条),其中第6条、第8条、第9条和第10条染色体分布最多(4个),第12条分布最少(1个).同一亚类里枣GATA转录因子含有相同的保守基序,基因结构也比较相似.本研究对于进一步认识枣GATA单个基因的功能以及基因之间的功能、基因进化和分子育种具有重要的意义.
枣、GATA、转录因子、生物信息学
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S852.65;Q78;S512.1
国家自然科学基金;陕西省科技厅农业科技创新与攻关项目;陕西省教育厅省级重点实验室重点科研计划项目;国家农业科技攻关计划;延安大学校级科研项目;延安大学大学生创新训练项目;研究生科研创新项目
2018-10-31（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）
共9页
4863-4871
