柱花草EST-SSR标记的鉴定及应用
为获得有效的分子标记,并应用于柱花草的遗传学研究中.本研究基于柱花草转录组测序获得的36 558条EST序列,利用MISA和PRIMER 3.0软件进行EST-SSR标记开发,对所开发标记进行特征分析,最终获得柱花草新EST-SSR标记2 008对,然后随机合成523对SSR标记并对其有效性及应用效果进行评价.其中主要重复类型是二核苷酸、三核苷酸,分别占30.50％和50.33％,在二、三核苷酸中的优势重复类型分别为AG/CT,AAG/CTT.在随机合成的523对引物中,472对引物都有扩增产物,扩增效率达到90.25％,其中有多态性的引物179对,占可扩增引物的37.92％,具有较高的多态性.利用新EST-SSR标记分析表明55份F1单株均为真杂种,并能对F2群体单株进行基因型鉴定.本研究开发的新EST-SSR标记将为柱花草遗传图谱的构建、基因克隆、指纹图谱构建奠定基础.
柱花草、EST-SSR、有效性、多态性
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S571.1;S634.3;Q94
海南省自然科学基金;中央级公益性科研院所基本科研业务费专项;岗位科学家项目
2016-07-08（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）
1195-1202
