毛果杨HDA902基因的克隆、序列分析和亚细胞定位
组蛋白去乙酰化酶(histone deacetylases,HDACs)是一类重要的酶,催化组蛋白去乙酰化,参与组蛋白乙酰化状态的调节,对染色体结构修饰和基因表达调控发挥着重要的作用.为了研究毛果杨HDA902基因的亚细胞定位,进而为研究其功能奠定基础,采用PCR的方法克隆了毛果杨组蛋白去乙酰化酶基因HDA902的编码序列,采用生物信息学方法分析了该基因所编码的蛋白质序列,并构建了HDA902-GFP融合基因表达载体,通过其在洋葱表皮细胞的表达来确定HDA902蛋白的亚细胞定位.研究结果表明,毛果杨HDA902基因的开放阅读框为1500 bp,编码1个由499个氨基酸残基组成的蛋白质.序列比对和结构域分析显示,毛果杨HDA902蛋白与其他植物同源蛋白具有一个保守的结构域HDAC3.系统进化树分析表明,毛果杨HDA902蛋白在进化上与桃(Prunus persica) HDAC(XP_007200978.1)和苹果(Malus domestica)HDA 19-like (XP_008348955.1)的亲缘关系较近.启动子分析表明,毛果杨HDA902基因的启动子序列包含5UTR Pyrich stretch、ARE、ACE和HSE等多个与逆境和光响应相关的顺式作用元件.亚细胞定位分析表明,毛果杨HDA902蛋白主要存在于细胞质中.这些研究结果为进一步研究毛果杨组蛋白去乙酰化酶HDA 902基因的功能提供了理论基础.
毛果杨、组蛋白去乙酰化酶、基因克隆、生物信息学、亚细胞定位
14
S852.65;TS207.4;Q78
黑龙江省博士后科学基金;国家自然科学基金
2016-07-08（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）
1082-1090
