紫薇叶片转录组分析及叶绿素和类胡萝卜素等途径基因的鉴定
应用新一代高通量测序技术,对紫薇金叶突变体的叶片进行转录组测序和生物信息学分析.本研究中共组装获得45308条unigenes,平均长度987.51 bp.21339 (47.10%)条可以匹配到蛋白数据库获得注释信息.Unigenes在各数据库中注释的基因数分别为:在COG数据库中有11512 (25.41%)条,在GO数据库中有12196条(26.92%),在KEGG数据库中有5709条(27.73%).通过与NCBI和Uniprot蛋白数据库的比对,共22条叶绿素代谢相关基因和17条类胡萝卜素代谢相关基因被鉴定出来,为突变体基因的筛选提供了候选基因.
紫薇、突变体、叶绿体、转录组
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S542;S791.11;S668.3
科技部农业科技成果转化资金;江苏省农业科技自主创新项目;江苏省林业三新工程项目;创新基金
2016-07-08(万方平台首次上网日期,不代表论文的发表时间)
1059-1066