甜玉米胚乳突变基因shrunken2的序列变异解析
Shrunken2基因编码葡萄糖焦磷酸化酶的大亚基,是玉米淀粉合成途径中的限速酶,shrunken2是Shrunken2的隐性突变等位基因,对甜玉米品质和风味的形成起着重要的作用.本研究以玉米B73的Shrunken2基因为参考序列,在58份甜玉米自交系中进行shrunken2基因的重测序,共获得了7635 bp的核苷酸序列,涵盖了20个外显子,17个内含子以及3'UTR区域.基因多态性分析发现,在供试群体中共有多态性位点105个,包括78个SNP和27个Indel.与普通玉米B73的Shrunken2序列之间存在58个多态性位点差异,包括50个SNP和8个Indel,其中位于编码区的SNP位点包含2个同义突变和7个非同义突变.根据shrunken2基因全长序列和编码区序列可将该群体分成14种和4种单倍型.中性检测表明该基因经历了自然和人工双重选择过程.
甜玉米、Shrunken2、序列多态性、中性检测、单倍型
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S513;S331;S823.81
实验室建设项目;广东省农业科技研究团队项目;广东省科技计划;广东省科技计划;广东省科技计划;广东省科技计划
2016-07-08(万方平台首次上网日期,不代表论文的发表时间)
1049-1058