现代月季Ty1-copia类逆转座子逆转录酶序列的克隆及分析
本研究以8个现代月季品种为试验材料,根据Ty1-copia类逆转座子逆转录酶的保守区设计简并引物,通过PCR扩增,从现代月季基因组中扩增出260 bp左右的目标条带。将扩增产物纯化后克隆于pMD 18-T质粒载体,选择阳性克隆,再经菌落PCR鉴定、测序及序列分析,获得19条来源于现代月季的Ty1-copia类逆转座子逆转录酶序列。研究发现这些序列的核苷酸长度集中于258~268 bp,存在较高的异质性,同源性范围3.4%~81.6%,主要表现在缺失突变,通过核苷酸聚类分析分为四类家族。翻译成氨基酸后,发现存在移框突变和终止密码子突变的现象,将这19条来源于现代月季的逆转录酶序列与登录在NCBI上来自于其它植物的Ty1-c op ia类逆转座子逆转录酶的氨基酸序列聚类分析,结果表明现代月季与其它物种间具有较高的同源性,表明Ty1-copia类逆转座子逆转录酶序列在不同物种之间可能存在横向传递。
现代月季、Ty1-copia类逆转录转座子、逆转录酶、异质性
S68;S51
高等学校博士学科点专项科研基金项目20122325110007
2014-12-23(万方平台首次上网日期,不代表论文的发表时间)
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