10.3969/j.issn.1672-416X.2006.03.023
植物SNP数据库及转化CAPS的方法
单核苷酸多态性(SNP)在植物基因组中广泛存在,基于SNP的分子标记也正越来越广泛地应用到植物基因定位、图位克隆及分子标记辅助育种等方面.模式植物拟南芥和水稻的全基因组序列测定已经完成,拟南芥有两种生态型完成了全序列测定,水稻有两个品种完成了全序列测定.许多植物有来自不同品种或不同组织器官或生长发育阶段的大量的EST序列.这些序列是植物SNP开发的重要资源.利用生物信息学手段对全基因组序列或EST序列进行分析已经形成了许多SNP位点数据库,这些数据库的建立为基于SNP的基因功能研究及分子标记开发提供了宝贵的资源.本文对植物SNP位点开发涉及的数据库资源及已经形成的SNP位点数据库进行了总结,并讨论了将SNP位点转化成CAPS或dCAPS标记的方法和相应的工具软件.
单核苷酸多态性、SNP数据库、酶切扩增多态性序列
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Q94;R37
国家科技攻关项目2002AA2070002;天津市科技攻关项目043122411
2006-06-26(万方平台首次上网日期,不代表论文的发表时间)
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