猪繁殖与呼吸综合征病毒CHsx1401株GP5蛋白基因的生物信息学分析
为了对猪繁殖与呼吸综合征病毒GP5蛋白的结构和功能进行探究,本研究对PRRSV当前流行株CHsx1401的GP5蛋白基因进行生物信息学分析.结果显示,CHsx140株GP5蛋白基因全长603 bp,编码200个氨基酸;分子质量为22 152.89 Da,理论等电点为8.276,不稳定性系数为37.54,属于稳定的疏水性蛋白;信号肽预测显示GP5蛋白在第1～31位氨基酸处存在信号肽;亚细胞定位预测GP5蛋白主要分布于内质网;跨膜螺旋结构预测显示GP5蛋白存在2个跨膜螺旋结构域;且其存在30个O-糖基化位点和39个磷酸化位点;抗原性分析显示GP5蛋白柔韧性差,表面可及性区域少,有多个抗原指数较高区域;GP5蛋白二级结构中以α螺旋为主.氨基酸同源性和序列比对结果显示PRRSV CHsx1401株GP5的氨基酸与NADC30株的同源性最高,与HUN4株同源性最低,且CHsx1401株GP5蛋白存在多个氨基酸突变位点;GP5蛋白基因系统进化分析显示CHsx1401株与NADC30株位于同一个分支,遗传距离最近,与QYYZ株遗传距离最远.本研究对PRRSV CHsx1401株GP5蛋白基因进行生物信息学分析,为进一步研究PRRSV GP5蛋白的结构和功能提供参考.
猪繁殖与呼吸综合征病毒、GP5蛋白基因、生物信息学
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S828.3(家畜)
国家自然科学基金31902279
2023-07-21（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）
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