10.3969/j.issn.2095-2163.2019.05.007
基于R语言的前列腺癌样本的关键基因数据挖掘
为寻找前列腺癌组织与正常前列腺组织的关键基因,从Gene Expression Omnibus (GEO)数据库下载前列腺癌样本基因表达谱数据集GSE69223.进行芯片标准化处理后设置阚值|log2 (FC) |＞2且pvalue ＜0.05筛选出差异表达的基因,选择其中高表达的41个基因进行GO和KEGG分析,得出8个关键基因:FFAR2、THBS4、TRPM4、CLDN3、CLDN8、HPN、PLA2G2A和FOLH1基因.再经UALCAN生存分析的到3个上调后患者生存可能性降低的基因:FFAR2、HPN和FOLH1.得出的8个关键基因主要富集在细胞趋化性、细胞-细胞连接、脂肪酸代谢等通路,这些通路与前列腺癌的发生发展有着密切联系.除文献已经报道的与前列腺癌有密切联系的基因外,研究推测:CLDN3、CLDN8和FFAR2基因可能与前列腺癌特别是处于T2、T3分期的前列腺癌有着潜在的联系.
R语言、数据挖掘、前列腺癌、关键基因
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TP311.13(计算技术、计算机技术)
贵州省科技计划项目黔科合基础[2019]1208号
2020-01-13（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）
共6页
30-34,39
