10.11748/bjmy.issn.1006-1703.2023.09.021
CapG在肝细胞癌中的表达及临床意义
目的 利用在线生物信息学数据库,通过组织和细胞水平的实验验证CapG基因在肝癌中的表达和临床意义.方法 通过分析UALCAN和GEPIA数据库,获得CapG基因在肝细胞癌患者中的mRNA转录表达水平、DNA甲基化状态和临床病理特征等;用Kaplan-Meier Plotter绘制肝细胞癌患者的生存曲线,用HPA分析CapG的蛋白水平,用Kaplan-Meier Plotter绘制肝细胞癌患者的生存曲线,用HPA分析CapG的蛋白水平.用String网站构建相应蛋白的相互作用网络,用LinkedOmics工具对CapG共表达的基因进行富集分析;此外,用免疫组化法验证CapG在肝癌组织芯片中的表达,用定量PCR法测定CapG在肝癌细胞水平的表达.结果 肝癌患者肝组织中CapG基因的mRNA表达水平和蛋白水平均明显升高(P<0.001),CapG的高mRNA表达水平与DNA甲基化状态的降低明显相关.免疫组织学和细胞水平的实验结果证实了CapG在肝细胞癌中的明显高表达(P<0.05).String在线分析结果表明,与CapG相互作用的蛋白质参与了生物过程,包括参与肌动蛋白聚合、转录调控、蛋白质运输等生物过程;LinkedOmics富集分析表明,这些共同表达的基因在肝癌组织中可以促进细胞因子代谢过程、T细胞激活、免疫系统的调节、细胞黏附调节以及细胞黏附的蛋白质复合物的合成等.此外,CapG mRNA的高表达水平与肝癌患者的总生存期和疾病特异性生存期显著相关(P<0.001).结论 基于生物信息学和组织及细胞水平的实验表明,肝癌组织中CapG基因的高表达与肝癌患者的不良生存期密切相关.CapG基因可能是诊断和治疗肝癌患者的潜在靶点.
CapG、DNA甲基化、肝细胞癌、生物信息学
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R735.7(肿瘤学)
成都市卫生健康委员会;四川省医学会科研项目;成都市卫生健康委员会
2023-11-10（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）
共9页
1546-1554
