10.11748/bjmy.issn.1006-1703.2020.05.020
基于生物信息学方法探讨胃癌组织中miR-195的表达及临床意义
目的 通过生物信息学方法探讨miR-195在胃癌组织中的表达情况及其临床意义.方法 下载GEO和TCGA数据库中相关数据集,比较胃癌组织和正常胃组织中miR-195表达量,并分析miR-195表达量与胃癌患者临床特征的相关性.采用生物信息学方法预测miR-195的靶基因,利用R软件的“ClusterProfiler”包对靶基因进行GO和KEGG富集分析,通过STRING 11.0在线分析网站构建PPI网络,进一步筛选出miR-195的核心基因.结果 miR-195在胃癌组织中的表达水平低于正常胃组织,且对于胃癌具有较高的诊断价值(AUC＞ 0.7,P＜0.05);miR-195表达量与患者年龄、病理分级、TNM分期和淋巴结转移等密切相关(P＜0.05).GO分析显示,miR-195的靶基因主要富集在离子通道及转运蛋白、细胞发育等功能,KEGG分析主要涉及胃酸分泌、钙信号通路等.AFP、CDC6和COL1 A1为PPI网络中的核心基因,在胃癌中均表达上调,其中AFP和CDC6与miR-195表达量呈负相关(P＜0.05).结论 miR-195在胃癌组织中低表达,可作为抑癌基因参与胃癌的发生发展,并有潜力成为胃癌的诊断标志物及治疗靶点.
微小RNA195、胃癌、生物信息学、诊断
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Q811.4;R735.2(生物工程学(生物技术))
四川省卫生和计划生育委员会基金项目编号:17PJ519
2020-08-13（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）
共9页
805-812,855
