10.11748/bjmy.issn.1006-1703.2019.05.023
膀胱癌尿液差异蛋白鉴定及生物信息分析
目的:对膀胱癌患者和正常对照尿液中的差异蛋白进行鉴定和生物信息分析.方法:应用swiss-prot、ProtParam、Uniprot、Gene Ontology、KEGG等数据库对前期研究中筛选出的膀胱癌尿液差异蛋白分别从蛋白、基因、核酸水平进行基本理化性质、分子功能、参与生物进程、细胞组分、代谢途径等方面的综合分析.结果:前期研究中筛选出的30个差异点鉴定出22个蛋白质,合并去重后共得到14个蛋白质,分别为:β2微球蛋白;脂肪细胞型脂肪酸结合蛋白;凝溶胶蛋白;凝溶胶蛋白亚型1;肌红蛋白;纤维蛋白原α链;载脂蛋白A-I;前列腺素合成酶;AMBP蛋白;转甲状腺素蛋白;角蛋白1;角蛋白8;推测蛋白白蛋白;推测蛋白甘露聚糖结合凝集素丝氨酸蛋白酶2.其中KRT8、KRT1、FGA、APOA1、FABP4、ALB、GSN、B2M、MASP2、TTR 10个基因均具有蛋白结合的分子功能;PTGDS、ALB、TTR 3个基因均具有转运蛋白活性的分子功能;ALB、MB2个基因具有氧结合功能,ALB还具有抗氧化活性.筛选的差异蛋白中大部分具有相似的本体注解,APOA1参与了膀胱癌分子通路途径中的PPAR信号通路.结论:14个膀胱癌尿液差异蛋白具有各自不同的理化属性,其基因产物具有蛋白结合、转运蛋白活性、氧结合及抗氧化活性的分子功能;参与了转运和细胞骨架合成等生物进程.结合生物信息学分析和大量文献检索,为下一步的靶蛋白研究提供方向.
膀胱癌、生物信息学、尿液
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北京市自然科学基金7172106;首都医科大学附属北京世纪坛医院中青年学科骨干培养专项2015-QB07;北京市医院管理局“登峰”人才培养计划DFL20150701
2019-07-01（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）
共8页
815-821,840
