OFFGEL和LC-MS联用分析SH-SY5Y细胞分泌蛋白质组
建立了游离胶分馏器(OFFGEL)和反相液相色谱质谱(LC-MS)联用分析SH-SY5Y细胞分泌蛋白质组的新方法.收集SH-SY5Y胞外蛋白用胰酶酶切成肽段后,用OFFGEL进行预分离并用LC-MS进行检测.用Mascot检索出88个蛋白,再通过生物信息学软件SignalP对Mascot检索的蛋白进行预测和筛选,共得到31种蛋白,用SingalP中的神经网络法和隐马可夫模型对其中的CERU_HUMAN进行分析,发现该蛋白是分泌蛋白,且信号肽的剪切位点在第19和第20氨基酸之间,软件SingalP提升了鉴定分泌蛋白的可靠性.
分泌蛋白组、游离胶分馏器、液相色谱质谱、生物信息学
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O657.63(分析化学)
北京理工大学研究生科技创新基金资助项目AA200805
2012-03-05（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）
共4页
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